Virtuose du Net, Lisbeth Salander, emprisonnée pour une peine injustifiée, doit affronter une détenue violente et surtout élucider des informations sur son passé. Léo Mannheimer, homme d’affaires et musicien doué, vit mal, malgré un environnement favorable. Le directeur du journal Millenium s'intéresse à ces deux personnages, remonte le temps, retrouve des traces et des témoins de pratiques suspectes. Qui sont les responsables de l'enfance secouée de Lisbeth et Léo ? La terrifiante vérité sera-t-elle débusquée ?